Бухта Аяя находится на северо-восточном берегу Байкала, в устье реки Аяя. Она врезается в сушу на 4 километра и окружена крутыми берегами, защищающими от ветров. На востоке — песчаный пляж и равнина с лесами. Вода у берега летом прогревается до 25–28 градусов. У входа в бухту есть подводный риф, где часто отдыхают нерпы.

Добраться можно на катере из Северобайкальска или Нижнеангарска, но нужно разрешение от администрации Фролихинского заказника, на территории которого находится бухта.